Mutaciones son cambios aleatorios en el ADN que pueden ser causados por agentes del entorno tales como rayos Ultra Violeta, carcinógenos, y otros químicos tóxicos. Estas mutaciones en ocasiones causan un resultado inesperado en alrededor de 2% de los casos que sometemos a prueba. Tales mutaciones no tienen ninguna implicación de salud o física, pero pueden complicar los resultados de una prueba de paternidad. En caso de mutación, podemos llevar a cabo pruebas adicionales y análisis estadísticos para determinar la paternidad con mayor precisión.